学校现拥有附属奉贤区中心医院、附属周浦医院、附属嘉定区中心医院和附属喀什地区第二人民医院共4所附属医院,正在筹建附属浦东新区人民医院、附属上海市第六人民医院金山分院、附属崇明区中心医院、附属上海禾新医院、附属第一康复医院(江湾医院)、附属精神卫生中心(杨浦区精神卫生中心)、附属赫尔森康复医院7所附属医院。